Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PrkraQ9WTX2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PrkraQ9WTX2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms