Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb3Q9R1P1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb3Q9R1P1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb3Q9R1P1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psmb3Q9R1P1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Psmb3Q9R1P1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms