Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ntn3Q9R1A3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms