Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Nek3Q9R0A5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nek3Q9R0A5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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