Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AmfrQ9R049 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AmfrQ9R049 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms