Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CtsjQ9R014 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms