Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Col4a3Q9QZS0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col4a3Q9QZS0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms