Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf10bQ9QZM4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms