Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Gpc1Q9QZF2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gpc1Q9QZF2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gpc1Q9QZF2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc1Q9QZF2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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