Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ubxn8Q9QZ49 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ubxn8Q9QZ49 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms