Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Opn4Q9QXZ9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn4Q9QXZ9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Opn4Q9QXZ9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Opn4Q9QXZ9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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