Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpsf3Q9QXK7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms