Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChmQ9QXG2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms