Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trp53inp1Q9QXE4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trp53inp1Q9QXE4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms