Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim44Q9QXA7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim44Q9QXA7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms