Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trpc5Q9QX29 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trpc5Q9QX29 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms