Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rai2Q9QVY8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms