Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Dkk3Q9QUN9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Dkk3Q9QUN9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms