Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msh5Q9QUM7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msh5Q9QUM7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms