Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cabp1Q9JLK7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms