Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hmgn5Q9JL35 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgn5Q9JL35 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hmgn5Q9JL35 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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