Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scamp4Q9JKV5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms