Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ldb3Q9JKS4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ldb3Q9JKS4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms