Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Irx5Q9JKQ4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Irx5Q9JKQ4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms