Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl39Q9JKF7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl39Q9JKF7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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