Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pard6bQ9JK83 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6bQ9JK83 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms