Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smpd3Q9JJY3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smpd3Q9JJY3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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