Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Scube2Q9JJS0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scube2Q9JJS0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms