Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc86Q9JJ89 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc86Q9JJ89 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms