Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LratQ9JI60 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms