Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird1Q9JI57 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms