Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn12Q9ET43 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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