Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1Q9ESG2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ropn1Q9ESG2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ropn1Q9ESG2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms