Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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OtofQ9ESF1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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OtofQ9ESF1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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OtofQ9ESF1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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OtofQ9ESF1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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OtofQ9ESF1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtofQ9ESF1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms