Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc28a3Q9ERH8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc28a3Q9ERH8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Slc28a3Q9ERH8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slc28a3Q9ERH8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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