Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clstn2Q9ER65 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clstn2Q9ER65 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms