Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsc1Q9EP53 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc1Q9EP53 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms