Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD03

Rab13, Ras-related protein Rab-13, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab13Q9DD03 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab13Q9DD03 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab13Q9DD03 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab13Q9DD03 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms