Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mrpl4Q9DCU6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mrpl4Q9DCU6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms