Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne8Q9DC53 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne8Q9DC53 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms