Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smg9Q9DB90 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Smg9Q9DB90 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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