Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chmp2aQ9DB34 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chmp2aQ9DB34 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms