Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpf4Q9DAW6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms