Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgf29Q9DA08 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sgf29Q9DA08 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms