Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Subh2bvQ9D9Z7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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