Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9S1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9D9S1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms