Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Cldn34b2Q9D9N2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn34b2Q9D9N2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn34b2Q9D9N2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms