Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmco5aQ9D9D5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmco5aQ9D9D5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms