Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TcimQ9D915 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TcimQ9D915 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TcimQ9D915 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TcimQ9D915 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TcimQ9D915 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TcimQ9D915 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TcimQ9D915 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TcimQ9D915 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TcimQ9D915 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TcimQ9D915 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms