Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Fam3aQ9D8T0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Fam3aQ9D8T0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Fam3aQ9D8T0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam3aQ9D8T0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam3aQ9D8T0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Fam3aQ9D8T0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Fam3aQ9D8T0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam3aQ9D8T0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms